В 21 из 25 административных территорий региона наблюдается активность клещей, которые могут быть переносчиками клещевого энцефалита. 

К этим территориям относятся Вельский, Ленский, Онежский, Верхнетоемский, Вилегодский, Виноградовский, Каргопольский, Коношский, Котласский, Красноборский, Няндомский, Пинежский, Плесецкий, Приморский, Устьянский, Холмогорский, Шенкурский округа, а также города Архангельск, Коряжма, Котлас и Мирный.

Неэндемичными территориями остаются Северодвинск, Новодвинск, Мезенский и Лешуконский округа.

По данным на 15 мая 2025 года, с начала сезона за медицинской помощью после укусов клещей обратились 1027 человек. Наибольшее количество случаев зарегистрировано в Котласе (184), Вельском районе (121), Котласском (82), Устьянском (77), Коряжме (76) и Архангельске (68). В Северодвинске зарегистрировано 61 обращение. В остальных районах число пострадавших варьируется от 3 до 51.

С начала года в регионе против клещевого энцефалита было привито 12 590 человек, из них 4220 — дети.